יהדות תימן זכתה למחקר נרחב. הייחוד של מחקרנו הוא בהתמקדות בשימוש של יהודי תימן בסממני המרפא מן הצומח, החי והמחצב, בשיטות הריפוי ובספרות הרפואית של המרפאים המסורתיים. השימוש בצמח רותם המדבר כנגד צהבת ילודים היא דוגמה לתרופה שהשימוש בה נמשך בארץ ישראל . חלק מהמחקר הוקדש לצמחי הבושם והקטורת שהיו בשימוש יהודי תימן לאור כל מעגל השנה. צמחית תימן השפיעה על רבני תימן באופן זיהוי  הצמחים בספרות ההלכתית, כפי שעולה ב"מחברת צמחי המשנה של הרב יוסף קאפח" שהוצאנו לאור.

בנוסף, המחקר עוסק בתרבות החומרית וחיי היום של יהודי תימן, כגון, מבנה הבית וכליו, ספריית המשכילים, מלאכה ומסחר ועוד. תחום נוסף הוא תיעוד מסורות כשרות אותנטיות, כגון אכילת הארבה בגיבוי רבני תימן, כשרות הדרור, הקורא והפניניה ועוד.

כמו כן פורסם מיזם שבו לוקטו מאות מנהגי ההלכה הייחודים של יהודי תימן מהזרם ה"בלדי" בהשוואה לנוסח ה"שאמי" ושאר קהילות ישראל.  דוגמות למחקרים בנושא מנהגי תימן הקדומים הם: "הזמנה לברית מילה", מנהג לתיתת החיטה למצות של פסח בצמחים  ותיעוד התפילין העתיקות.

מחקרים נוספים עסקו בתחום התרבות החומרית של יהודי תימן, בעיקר במזון, בשמים וקטורת לאור מקורות מגוונים ובהם תכאליל ודיוואנים עתיקים.

תפילין עתיקות מתימן

דוגמאות למחקרי תימן:

• ספר החילוקים בין בני תימן לבין בני הצפון, אסופת מנהגי 'זרם הבלדי' לגוניו, נוה צוף תשע"ז (ראו דברי ההקדמה).
• "הפירוש התימני של זיהוי צמחי המשנה לרבנו נתן אב הישיבה", בתוך: מטוב יוסף, ספר היובל לכבוד יוסף טובי (א' אטינגר וד' בר-מעוז עורכים), ב, חיפה תשע"א, עמ' 11 – 22. (בשיתוף עם א' קאפח).
• "הרב חיים כסאר ושיפור ייצור התפילין בתימן", תהודה, 32 (תשע"ז), עמ' 22 – 33.
• "הזמנה לברית המילה בנוסח יהודי תימן", מסורה ליוסף, ו  (י' פרחי עורך), נתניה תשס"ט, עמ' 289 – 294.
• "השימוש ברותם בטיפול בצהבת ילודים במסורת יהודי תימן", תהודה, 28 (תשע"ב), עמ' 132 – 136.
• "מפנקסו של חנווני יהודי מצנעא", בתוך: בני תימן: מחקרים ביהדות תימן ומורשתה, רמת גן תשע"א, עמ' 117 – 133.
• "רכושה של משפחה יהודית מן המעמד הבינוני בתימן", תימא, יד (תשע"ז), עמ' 123 – 135.
•  "אכילת צפורי דרור (עצפר) במסורת יהודי תימן", אפיקים, קכג-קכד (תשס"ג),  עמ' 51 – 52.
• "אכילת חגבים: שימור שקיעי תרבות תלמודית בקרב יהודי תימן", עטרת יצחק (י' טובי עורך), נתניה תשס"ד, עמ' 177 – 196.
• "בין רפואת אתיופיה לתימן", תהודה, 25 (תשס"ח), עמ' 68 – 73 (בשיתוף עם ד' דנינו).
•  "עניות נוסח תימן", תהודה, 27 (תשע"א), עמ' 49 – 51.
• "גידולי תימן על פי אלואסעי", תהודה, 33 (תשע"ח), עמ' 9 – 21 (בשיתוף עם י' סרי).
• אבני חן מתימן
• השימוש הרפואי באבני חן בתימן
• "מנהג הטינון בעשבים להכנת מצות במסורת תימן", תימא, ז (תשס"א), עמ' 177 – 186 (המאמר המעודכן פורסם בספר חמשת מיני דגן).
• "צמחי תימן בכתבי הרב יוסף קאפח", בתוך: תזונה ורפואה עממית (ז' מדר וי' ריעאני עורכים), תל אביב  תשס"ה, עמ' 157 – 168.
• "חומרי המרפא אצל יהודי תימן", בתוך: תזונה ורפואה עממית (ז' מדר וי' ריעאני עורכים), תל אביב תשס"ה,  עמ'  169 – 188.
• "המרפא התימני מארי סאלם חביב", תהודה 41 (תשפ"ב), עמ' 375 – 379.
•  "הזבאד בתרבות יהודי תימן", תהודה, 40 (תשפ"א), עמ' 275 – 284.
• "'ברכות הנהנין' בנוסח יהודי עדן", תימא, יז (תש"פ), עמ' 80 – 102 (בשיתוף עם ד' יעקב)
• "צמחי מאכל ובשמים בתימן לאור התכלאל", תימא, יט (תשפ"ב), עמ' 89 - 149.
• "קהילת שבאם בעת החדשה: מזיכרונות יוסף ויחיאל עמר", תהודה, 42 (תשפ"ג), עמ' 339 - 346.
• "שיעורי תורה על פי שיטת הרמב"ם ומנהג תימן הקדום", תחומין, מג (תשפ"ג), עמ' 507 -520
• "התנצחות בין צמחים ובשמים בשירת יהודי תימן", תימא, כא (תשפ"ג), עמ' 109 - 140.
• "מארי יעיש גיאת - מרפא תימני מסורתי", תהודה, 43 (תשפ"ג), עמ' 277 - 282.
• "אבני חן בתימן והשימוש הרפואי בהן", בתוך: לקט אורות: אסופת מאמרים לכבוד ד"ר אורי מלמד (נ' אילן עורך), ירושלים תשפ"ד, עמ' 403 - 412.